Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms