Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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