Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms