Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Cnot7Q60809 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms