Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psme4Q5SSW2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms