Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms