Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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