Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms