Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms