Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rundc1Q0VDN7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms