Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sh3bp2Q06649 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sh3bp2Q06649 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms