Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox12Q04890 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms