Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psme1P97371 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms