Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms