Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms