Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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