Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Otx1P80205 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms