Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gfi1P70338 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms