Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfixP70257 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfixP70257 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NfixP70257 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms