Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtnP63089 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtnP63089 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtnP63089 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtnP63089 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms