Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tra2bP62996 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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