Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Polr2iP60898 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms