Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp3P58854 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms