Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp25P57080 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms