Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms