Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtshP49935 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtshP49935 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtshP49935 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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