Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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