Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Syt4P40749 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syt4P40749 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syt4P40749 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syt4P40749 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Syt4P40749 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Syt4P40749 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms