Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
ThpoP40226 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms