Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pola1P33609 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms