Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms