Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprmP28828 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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