Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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