Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms