Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tsta3P23591 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tsta3P23591 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tsta3P23591 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tsta3P23591 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tsta3P23591 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tsta3P23591 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms