Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms