Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TP20293 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TP20293 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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