Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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