Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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