Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Irf1P15314 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms