Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms