Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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