Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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