Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PdgfrbP05622 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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