Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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H2-Eb1P04230 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2-Eb1P04230 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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