Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tgfb1P04202 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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