Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms