Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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DffaO54786 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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