Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hps1O08983 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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