Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Efna3O08545 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms